Hal Ehwal Murid Sekolah Mempunyai Tekad Dan Komitmen Terhadap Prestasi Murid Khususnya Dari Aspek Akhlak Dan Sahsiah Serta Ketrampilan Mereka. Atas Dasar Inilah, Matlamat Dan Objektif Pengurusan HEM Bertunjang Kepada Kebajikan, Keselamatan Dan Akhlak Serta Disiplin Murid Sentiasa Pada Tahap Yang Baik Serta Berkualiti Sehingga Mampu Memberi Sumbangan Kepada Bangsa, Agama Dan Negara.
Kejayaan Cemerlang Sesebuah Sekolah Banyak Bergantung Kepada Bagaimana Sekolah Menguruskan Hal-Hal Berkaitan Disiplin, Sahsiah Dan Komitmen Murid-Muridnya.
Atas Dasar Inilah Pihak Sekolah Telah Merancang Dan Melaksanakan Pelbagai Program Yang Dianjurkan Oleh Unit HEM Untuk Memastikan Matlamat Sekolah Tercapai. Kerjasama Yang Erat Antara Semua Guru Dan Murid Mampu Merealisasikan Wawasan Sekolah.
Membantu Dalam Perkembangan Diri Dan Sahsiah Murid Supaya Murid Berfungsi Sebagai Individu Yang Seimbang, Berdikari, Berpengetahuan Dan Berkemahiran, Berfikiran Kreatif Dan Kritikal, Memupuk Potensi Dan Berkebolehan Ke Tahap Maksima Dan Menyuburkan Potensi Kepimpinan.
Sekolah Agama Menengah Tinggi Tengku Ampuan Jemaah Memainkan Peranan Penting Dalam Memberikan Pendidikan Islam Kepada Para Pelajar. Pendidikan Islam Yang Diterima Di SAMTTAJ Adalah Selaras Dengan Kurikulum Yang Ditetapkan Oleh Jabatan Kemajuan Islam Malaysia (JAKIM). Selain Daripada Pendidikan Agama, SAMTTAJ Juga Memberikan Pendidikan Akademik Yang Lengkap Kepada Para Pelajar.
Mengurus, Merancang, Menyelia Dan Menyelaras Hal Ehwal Berkaitan Hal Ehwal Murid Seperti Program Pembangunan Modal Insan, Kebersihan Dan Keceriaan Sekolah Dan Bantuan Buku Sumber / Teks Di Peringkat Sekolah, Zon Dan Ibu Pejabat Mengurus Dan Menyelaras Aktiviti Ko-Kurikulum Di Peringkat Sekolah